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干货 | 核酸电泳解决方案
凝胶电泳是分子生物学中鉴定、量化和纯化核酸的常用实验技术。琼脂糖凝胶电泳是分离鉴定和纯化核酸片段的标准方法,因其快速便捷和通用性广,被广泛应用于核酸的分离和分析。
核酸在碱性缓冲液环境下带负电荷,当受到电场作用时会通过琼脂糖凝胶介质从负极(阴极)向正极(阳极)迁移,不同核酸分子片段由于分子和构型不同,在电场中的泳动速率也不同,较短的碎片比较长的碎片移动得更快,从而能达到分离的效果。在凝胶中加入染料,可对分离的核酸进行检测,加入 Marker可以相对确定片段的大小。
那么,进行核酸电泳实验有没有什么小妙招呢?今天,莫纳丽莎就来为大家介绍一下——如何进行标准的琼脂糖凝胶电泳操作!满满的干货,为你的实验全面助力!
一、准备工作
在正式开始电泳实验之前,首先要进行必要的准备工作:
01明确样品信息与电泳信息
样品信息确定DNA样品或者RNA样品数量,片段的大小,浓度;
电泳信息确定胶浓度、制胶大小以及电泳条件。
我们要先根据所分离片段大小的不同,明确最适宜的琼脂糖浓度。下表就为大家列出了不同琼脂糖凝胶浓度所对应的线性DNA最佳分辨范围:
02样品准备
PCR扩增产物检测配制PCR体系,PCR仪上运行程序,反应完成后取出;
酶切产物检测配制酶切体系,利用水浴锅或者金属浴进行反应,反应完成后取出;
总DNA/RNA检测提取核酸样品,在DNA样品或者RNA样品中加入上样缓冲液(loading buffer),混匀备用。
03确认仪器
确认电泳相关仪器可正常使用,包括水平电泳槽、电泳仪电源等。
二、开始电泳实验
01制胶
以制作1%的胶为例,称取0.5g琼脂糖加入50ml 1.0×TAE缓冲液,放入微波炉里加热至琼脂糖全部熔化,取出摇匀。然后向冷却至50-60℃的琼脂糖胶液中加入核酸染料溶液(或者电泳后用染料溶液浸泡染色)。再将琼脂糖小心倒入胶槽内,插好梳子(注意保证制胶模具和梳子的洁净)。
室温下20~30分钟后凝胶完全凝结,小心拔出梳子,将凝胶安放在电泳槽内,向槽内加入1.0×TAE稀释缓冲液至液面恰好没过胶板上表面。
02上样
用微量移液枪将样品小心加入样品槽中,总体积不可超过样品槽容量。注意上样时小心操作,避免损坏凝胶或将样品槽底部凝胶刺穿。
03电泳
盖好电泳上盖,接通电源,切记DNA样品由负极往正极泳动。一般当溴酚蓝条带移动到距凝胶前沿约2cm时,停止电泳。未加染料的胶在电泳完毕后移核酸溶液中,室温下染色10~30分钟。
核酸从负极移向正极
依照核酸片段大小进行分离
04凝胶成像与条带分析
根据所用染料的不同,我们可选择不同的凝胶成像光源:蓝光或紫外光。成像后,利用合适的分析软件进行条带的分析,即可以计算分子量和浓度等信息。
琼脂糖凝胶电泳成像图片
纵然每个人都希望得到完美的电泳条带,但是在实际的实验中还是会遇到各种各样的问题,导致跑出的结果不尽人意。
为此,莫纳丽莎总结了一些核酸电泳的常见问题与解决方案,希望可以给到大家一些帮助。以下是不是也有你正在苦苦追寻的答案呢?一起来看看吧!
三、常见问题与解决方案
Q1无条带或几乎看不到条带
Q2条带拖尾、弥散或分离效果不佳
Q3分离或迁移异常
好了,今天的核酸电泳解决方案就分享到这里啦!不知道大家是否在这篇干货里找到自己实验的影子呢?
欢迎莫粉儿们留言分享自己的实验心得与体会,让我们都在共同得交流学习中成为更出色的科研人!
还有更多关于电泳仪的问题欢迎联系集思。
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