在微生物诊断中，离心机通常用于将被测微生物从被检物料中分离出来，并获得纯培养物（即单个微生物的培养物），因此，通常用离心机对样品进行分离。微生物的离心分离培养方式是微生物学诊断中的一项重要基本操作。

分离单个微生物的方法很多。

1、将被检物料接种在合适的微生物培养基中，然后从固体培养基表面产生的细菌中选择一个待分离的细菌，并将其转移到另一个合适的微生物培养基中进行培养。由于单个细菌体通常由单个细菌生成繁殖产生，因此培养的细菌是单一类型，即纯培养；

2、利用独特的培养环境（如厌氧、二氧化碳环境等）进行细菌分离；

将被检物料接到子易患动物身体内，使致病菌在动物体内繁殖，然后从动物体内取出物料用离心机离心分离出所需的成分，然后进行培养。用对部分理化要素具有独特抵抗力的细菌，  用理化方法处理接种物料，杀死其他微生物，保留所需的细菌进行分离培养。

通常，可以用前两种方法分离和培养被检物料。如果被检物料污染严重，可先用后两种方法处理，然后再用前两种方法进行纯培养。

在分离培养操作中，严格执行无菌操作。所有用品、微生物培养基和试剂必须消毒，不能长时间暴露在空气中，禁止用手触摸或用嘴吹已杀菌的器皿內部。

被检物料中可能存在病原苗的特点，选择合适的微生物培养基和培养条件：（温度、气体环境等）。对不明细菌进行初步分离时，最好多使用几种微生物培养基，如肉汤、血琼脂、麦康克琼脂等，每种微生物培养基接种几根试管，分别在普通环境和厌氧环境中培养。通过24-78小时观察结果，但一些病原体需要在长时间培养后才能生成。

被检物料通常不需要处理，可以直接种植在微生物培养基上。当怀疑为带芽脑的病原苗时，加入生理盐水将被检物料研磨成1:10的乳剂（液体物料不需要稀释），放入60-80℃的水浴中20-30分钟，杀死无芽胞的杂菌，然后接种在微生物培养基中。

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