新的液相色谱柱都是保存在一定的保存液中的，所谓的活化就是替换掉其中的保存液，冲洗掉柱中可能残留的其他杂质，以免影响后续分析工作。液相色谱柱的活化方法因柱子而异。

反相色谱柱：使用新的C18柱时，先用甲醇或乙-腈冲洗20-30个柱体积，然后用甲醇/乙-腈：水（50:50）冲洗10个柱体积，然后再用流动相平衡10-30柱体积。正相色谱柱：新柱用流动相平衡20-30个柱体积。离子色谱柱（SAX, SCX）：新柱先用100%甲醇或乙-腈冲洗20个柱体积，然后转换到流动相平衡。不同的色谱柱活化的方法不尽相同，要根据柱子的种类来选择活化方法。另外，要提醒的是，柱子活化时不要接检测器，避免不必要的污染。

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