液相色谱根据分离机理的不同可分为：液-固吸附色谱、液-液分配色谱、离子交换色谱、离子对色谱法、分子排阻色谱(或凝胶渗透色谱)等。

1、液-固吸附色谱

流动相为液体，固定相为固体吸附剂，是通过组分在两相间的多次吸附与解吸平衡实现分离的。适合分离的物质为中等相对分子质量的油溶性试样，凡是能够用薄层色谱分离的物质均可用此法分离。

2、液相色谱仪液-液分配色谱

流动相和固定相都是液体的色谱法即为液液分配色谱。该方法是利用样品组分在两种不相溶的液相间的分配来进行分离。一种液相为流动相，另一种是涂于载体上的固定相。可以分离各种无机、有机化合物

流动相极性小于固定相极性的液-液色谱法称为正相分配色谱法。

流动相极性大于固定相极性的液-液色谱法称为反相分配色谱法。

3、离子交换色谱

以离子交换树脂或化学键合离子交换剂为固定相，利用被分离组分离子交换能力的差别或选择性系数的差别而实现分离。

按照可交换离子所带电荷符号的不同又可分为阳离子交换色谱法和阴离子交换色谱法。

离子交换色谱主要是用来分离离子或可离解的化合物。它不仅广泛地应用于无机离子的分离，而且广泛地应用于有机和生物物质，如氨基酸、核酸、蛋白质等的分离，在生物化学领域得到了广泛的应用。

4、液相色谱仪离子对色谱法

将一种或多种与目标化合物离子电荷相反的离子（称为离子对）加入到流动相或者固定相中，使其与目标化合物离子结合形成离子对化合物，从而影响目标化合物的保留行为。离子对色谱和反相色谱有很多共同的地方。使用的固定相和流动相大致相似，不同的是，在离子对色谱的流动相中加入了离子对试剂。

离子对试剂通常分为以下两类：

用于酸性化合物：三乙胺，四丁基氢氧化铵，四丁基溴化铵，十二烷基三甲基氯化铵等。

用于碱性物质：三氟乙酸，戊烷磺酸钠，己烷磺酸钠，庚烷磺酸钠，辛烷磺酸钠，十二烷基磺酸钠，十二烷基硫酸钠等。

具体离子对试剂的选择没有什么特殊的要求，根据目标化合物的酸碱性进行选择就好。如果目标化合物是弱酸性或弱碱性的，离子对试剂对应选择强碱性或强酸性为最佳。

离子对色谱法特别适合一些生化试样如核酸、核苷、生物碱以及药物等分离。

5、液相色谱仪分子排阻色谱法

分子排阻色谱法又称空间排阻色谱法（SEC）、凝胶色谱法，是利用多孔凝胶固定相的独特性产生的一种，主要根据凝胶孔隙的孔径大小与高分子样品分子的线团尺寸间的相对关系而对溶质进行分离分析的方法。

适用于对未知样品的探索分离，它能很快提供样品按分子大小组成的全面情况，并迅速判断样品是简单的还是复杂的混合合物，并提供样品中各组分的近似分子量。这种分离方法不宜用于分子大小组成相似或分子大小仅差10%的组分分析，如同分异构体的分离不宜用分子排阻色谱法。

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