在色谱分析中，如何选择最佳的色谱条件以实现最理想的分离，是色谱工作者的重要工作。色谱是一种分离分析的手段，分离是核心，因此可以说担负分离作用的色谱柱是色谱系统的心脏。因此选择一个合适的色谱柱非常重要。

对色谱柱的基础要求是：柱效高、选择性好，分析速度快等。目前市售的用于ＨＰＬＣ的各种色谱柱种类繁多，从色谱柱填料来分，可分为硅胶基质和有机杂化球基质的色谱柱，还有不同长短、不同微粒大小的色谱柱。

色谱柱的选择可根据待分析样品的极性、分子量大小、是否可溶于水等因素来考虑。如样品分子量大于２０００的，可溶于水的，可选择凝胶色谱柱、大孔径反相色谱柱、大孔径离子交换色谱柱。分子量小于２０００的，溶于有机相的，可选择正相模式色谱柱。溶于水，可电离的样品可选择反相模式色谱柱或离子交换或未经涂渍亲水模式的色谱柱等。

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