原理不一样：

水浴恒温振荡器的恒温加热是通过加热管加热，其中的原理是水浴锅的原理，在水槽中注入水，用加热管进行加热，通过加热管的控制来达到加热水、恒定温度的效果；而气浴恒温振荡器主要利用空气加热，通过鼓风装置实现温度的均匀，加热功率相对水浴振荡器要小很多。

控温峰值不一样：

温度控制的峰值温度不一样：水的峰值温度可以达到100℃，所以水浴的恒温范围是室温到99.9℃,而气浴由于是鼓风装置实现空气加热，受空气密度和仪器密封性等原因，峰值温度一般不超过70℃，所以气浴恒温振荡器的恒温范围要小一点，可以实现控温。

优缺点：

水浴恒温振荡器是通过一个独立的水套层包围内部的箱体来维持温度恒定的，水是一种很好的绝热物质，可以比较长时间的保持培养箱内的温度准确性和稳定性，有利于实验环境不太稳定并需要保持长时间稳定的培养条件的用户使用。

气浴恒温振荡器是通过遍布箱体气套层内的加热器直接对内箱体进行加热的，又叫六面直接加热。气浴式与水浴式相比，具有加热快，温度的恢复比水浴恒温振荡器迅速的特点，特别有利于短期培养以及需要箱门频繁开关的培养。此外，气浴温度的均匀性也相对要高一些，它主要应用于无水的实验环境。

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